生物化學生化重點總結-生化筆記(期末考研復試)

本站小編 免費考研網/2020-05-12/0

生物化學筆記
——2012 級臨床五年五班整理
第一篇    生物大分子的結構與功能
第一章    氨基酸和蛋白質

一、組成蛋白質的 20 種氨基酸的分類1、非極性氨基酸
包括:甘氨酸、丙氨酸、纈氨酸、亮氨酸、異亮氨酸、苯丙氨酸、脯氨酸  2、極性氨基酸
極性中性氨基酸:色氨酸、酪氨酸、絲氨酸、半胱氨酸、蛋氨酸、天冬酰胺、谷氨酰  胺、蘇氨酸
酸性氨基酸:天冬氨酸、谷氨酸
堿性氨基酸:賴氨酸、精氨酸、組氨酸
其中:屬于芳香族氨基酸的是:色氨酸、酪氨酸、苯丙氨酸 屬于亞氨基酸的是:脯氨酸
含硫氨基酸包括:半胱氨酸、蛋氨酸
注意:在識記時可以只記第一個字,如堿性氨基酸包括:賴精組

二、氨基酸的理化性質
1、兩性解離及等電點
氨基酸分子中有游離的氨基和游離的羧基,能與酸或堿類物質結合成鹽,故它是一種  兩性電解質。在某一PH的溶液中,氨基酸解離成陽離子和陰離子的趨勢及程度相等,成   為兼性離子,呈電中性,此時溶液的PH稱為該氨基酸的等電點。
2、氨基酸的紫外吸收性質
芳香族氨基酸在 280nm 波長附近有最大的紫外吸收峰,由于大多數蛋白質含有這些氨基酸殘基,氨基酸殘基數與蛋白質含量成正比,故通過對 280nm 波長的紫外吸光度的測量可對蛋白質溶液進行定量分析。
3、茚三酮反應
氨基酸的氨基與茚三酮水合物反應可生成藍紫色化合物,此化合物最大吸收峰在570nm 波長處。由于此吸收峰值的大小與氨基酸釋放出的氨量成正比,因此可作為氨基酸定量分析方法。

三、肽
兩分子氨基酸可借一分子所含的氨基與另一分子所帶的羧基脫去1分子水縮合成最簡單的二肽。二肽中游離的氨基和羧基繼續借脫水作用縮合連成多肽。10 個以內氨基酸連接而成多肽稱為寡肽;39 個氨基酸殘基組成的促腎上腺皮質激素稱為多肽;51 個氨基酸殘基組成的胰島素歸為蛋白質。
多肽連中的自由氨基末端稱為N端,自由羧基末端稱為C端,命名從N端指向C端。  人體內存在許多具有生物活性的肽,重要的有:
谷胱甘肽(GSH):是由谷、半胱和甘氨酸組成的三肽。半胱氨酸的巰基是該化合物的主要功能基團。GSH 的巰基具有還原性,可作為體內重要的還原劑保護體內蛋白質或酶分子中巰基免被氧化,使蛋白質或酶處于活性狀態。

四、蛋白質的分子結構
1、蛋白質的一級結構:即蛋白質分子中氨基酸的排列順序。 主要化學鍵:肽鍵,有些蛋白質還包含二硫鍵。
2、蛋白質的高級結構:包括二級、三級、四級結構。
1)蛋白質的二級結構:指蛋白質分子中某一段肽鏈的局部空間結構,也就是該段肽
 
鏈骨架原子的相對空間位置,并不涉及氨基酸殘基側鏈的構象。二級結構以一級結構為基   礎,多為短距離效應?煞譃椋
α-螺旋:多肽鏈主鏈圍繞中心軸呈有規律地螺旋式上升,順時鐘走向,即右手螺旋,  每隔 3.6 個氨基酸殘基上升一圈,螺距為 0.540nm。α-螺旋的每個肽鍵的N-H和第四個肽鍵的羧基氧形成氫鍵,氫鍵的方向與螺旋長軸基本平形。
β-折疊:多肽鏈充分伸展,各肽鍵平面折疊成鋸齒狀結構,側鏈R基團交錯位于鋸齒  狀結構上下方;它們之間靠鏈間肽鍵羧基上的氧和亞氨基上的氫形成氫鍵維系構象穩定.  β-轉角:常發生于肽鏈進行 180 度回折時的轉角上,常有4個氨基酸殘基組成,第二
個殘基常為脯氨酸。
無規卷曲:無確定規律性的那段肽鏈。主要化學鍵:氫鍵。
2)蛋白質的三級結構:指整條肽鏈中全部氨基酸殘基的相對空間位置,顯示為長距  離效應。
主要化學鍵:疏水鍵(最主要)、鹽鍵、二硫鍵、氫鍵、范德華力。
3)蛋白質的四級結構:對蛋白質分子的二、三級結構而言,只涉及一條多肽鏈卷曲  而成的蛋白質。在體內有許多蛋白質分子含有二條或多條肽鏈,每一條多肽鏈都有其完整   的三級結構,稱為蛋白質的亞基,亞基與亞基之間呈特定的三維空間排布,并以非共價鍵   相連接。這種蛋白質分子中各個亞基的空間排布及亞基接觸部位的布局和相互作用,為四   級結構。由一條肽鏈形成的蛋白質沒有四級結構。
主要化學鍵:疏水鍵、氫鍵、離子鍵

五、蛋白質結構與功能關系
1、蛋白質一級結構是空間構象和特定生物學功能的基礎。一級結構相似的多肽或蛋  白質,其空間構象以及功能也相似。
尿素或鹽酸胍可破壞次級鍵β-巰基乙醇可破壞二硫鍵
2、蛋白質空間結構是蛋白質特有性質和功能的結構基礎。
肌紅蛋白:只有三級結構的單鏈蛋白質,易與氧氣結合,氧解離曲線呈直角雙曲線。  血紅蛋白:具有4個亞基組成的四級結構,可結合4分子氧。成人由兩條α-肽鏈
(141 個氨基酸殘基)和兩條β-肽鏈(146 個氨基酸殘基)組成。在氧分壓較低時,與氧氣結合較難,氧解離曲線呈S狀曲線。因為:第一個亞基與氧氣結合以后,促進第二及第三個亞基與氧氣的結合,當前三個亞基與氧氣結合后,又大大促進第四個亞基與氧氣結 合,稱正協同效應。結合氧后由緊張態變為松弛態。

六、蛋白質的理化性質
1、蛋白質的兩性電離:蛋白質兩端的氨基和羧基及側鏈中的某些基團,在一定的溶  液PH條件下可解離成帶負電荷或正電荷的基團。
2、蛋白質的沉淀:在適當條件下,蛋白質從溶液中析出的現象。包括:
a.    丙酮沉淀,破壞水化層。也可用乙醇。
b.    鹽析,將硫酸銨、硫酸鈉或氯化鈉等加入蛋白質溶液,破壞在水溶液中的穩定因素  電荷而沉淀。
3、蛋白質變性:在某些物理和化學因素作用下,其特定的空間構象被破壞,從而導  致其理化性質的改變和生物活性的喪失。主要為二硫鍵和非共價鍵的破壞,不涉及一級結   構的改變。變性后,其溶解度降低,粘度增加,結晶能力消失,生物活性喪失,易被蛋白   酶水解。常見的導致變性的因素有:加熱、乙醇等有機溶劑、強酸、強堿、重金屬離子及   生物堿試劑、超聲波、紫外線、震蕩等。
4、蛋白質的紫外吸收:由于蛋白質分子中含有共軛雙鍵的酪氨酸和色氨酸,因此在
280nm 處有特征性吸收峰,可用蛋白質定量測定。5、蛋白質的呈色反應
a.    茚三酮反應:經水解后產生的氨基酸可發生此反應,詳見二、3
b.    雙縮脲反應:蛋白質和多肽分子中肽鍵在稀堿溶液中與硫酸酮共熱,呈現紫色或紅
 
色。氨基酸不出現此反應。蛋白質水解加強,氨基酸濃度升高,雙縮脲呈色深度下降,可   檢測蛋白質水解程度。

七、蛋白質的分離和純化1、沉淀,見六、2
2、電泳:蛋白質在高于或低于其等電點的溶液中是帶電的,在電場中能向電場的正  極或負極移動。根據支撐物不同,有薄膜電泳、凝膠電泳等。
3、透析:利用透析袋把大分子蛋白質與小分子化合物分開的方法。  4、層析:
a.    離子交換層析,利用蛋白質的兩性游離性質,在某一特定PH時,各蛋白質的電荷量及性質不同,故可以通過離子交換層析得以分離。如陰離子交換層析,含負電量小的蛋   白質首先被洗脫下來。
b.    分子篩,又稱凝膠過濾。小分子蛋白質進入孔內,滯留時間長,大分子蛋白質不能  時入孔內而徑直流出。
5、超速離心:既可以用來分離純化蛋白質也可以用作測定蛋白質的分子量。不同蛋  白質其密度與形態各不相同而分開。

八、多肽鏈中氨基酸序列分析
a.    分析純化蛋白質的氨基酸殘基組成
(蛋白質水解為個別氨基酸,測各氨基酸的量及在蛋白質中的百分組成)

測定肽鏈頭、尾的氨基酸殘基
二硝基氟苯法(DNP 法)
尾端    羧肽酶A、B、C法等
丹酰氯法

水解肽鏈,分別分析
胰凝乳蛋白酶(糜蛋白酶)法:水解芳香族氨基酸的羧基側肽鍵 胰蛋白酶法:水解賴氨酸、精氨酸的羧基側肽鍵
溴化脯法:水解蛋氨酸羧基側的肽鍵

Edman 降解法測定各肽段的氨基酸順序
(氨基末端氨基酸的游離α-氨基與異硫氰酸苯酯反應形成衍生物,用層析法鑒定  氨基酸種類)
b.    通過核酸推演氨基酸序列。
第二章    核酸的結構與功能

一、核酸的分子組成:基本組成單位是核苷酸,而核苷酸則由堿基、戊糖和磷酸三種成分   連接而成。
兩類核酸:脫氧核糖核酸(DNA),存在于細胞核和線粒體內。 核糖核酸(RNA),存在于細胞質和細胞核內。
1、堿基:
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嘌呤和嘧啶環中均含有共軛雙鍵,因此對波長 260nm 左右的紫外光有較強吸收,這
 
一重要的理化性質被用于對核酸、核苷酸、核苷及堿基進行定性定量分析。
2、戊糖:DNA 分子的核苷酸的    糖是β-D-2-脫氧核糖,RNA 中為β-D-核糖。3、磷酸:生物體內多數核苷酸的磷酸基團位于核糖的第五位碳原子上。

二、核酸的一級結構
核苷酸在多肽鏈上的排列順序為核酸的一級結構,核苷酸之間通過 3′,5′磷酸二酯鍵連接。

三、DNA 的空間結構與功能1、DNA 的二級結構
DNA 雙螺旋結構是核酸的二級結構。雙螺旋的骨架由 糖和磷酸基構成,兩股鏈之間的堿基互補配對,是遺傳信息傳遞者,DNA 半保留復制的基礎,結構要點:
a.    DNA 是一反向平行的互補雙鏈結構 親水的脫氧核糖基和磷酸基骨架位于雙鏈的外側,而堿基位于內側,堿基之間以氫鍵相結合,其中,腺嘌呤始終與胸腺嘧啶配對,形成兩個氫鍵,鳥嘌呤始終與胞嘧啶配對,形成三個氫鍵。
b.    DNA 是右手螺旋結構 螺旋直徑為 2nm。每旋轉一周包含了 10 個堿基,每個堿基的旋轉角度為 36 度。螺距為 3.4nm,每個堿基平面之間的距離為 0.34nm。
c.    DNA 雙螺旋結構穩定的維系 橫向靠互補堿基的氫鍵維系,縱向則靠堿基平面間的疏水性堆積力維持,尤以后者為重要。
2、DNA 的三級結構
三級結構是在雙螺旋基礎上進一步扭曲形成超螺旋,使體積壓縮。在真核生物細胞核  內,DNA 三級結構與一組組蛋白共同組成核小體。在核小體的基礎上,DNA 鏈經反復折疊形成染色體。
3、功能
DNA 的基本功能就是作為生物遺傳信息復制的模板和基因轉錄的模板,它是生命遺傳繁殖的物質基礎,也是個體生命活動的基礎。
DNA 中的核糖和磷酸構成的分子骨架是沒有差別的,不同區段的 DNA 分子只是堿基的排列順序不同。

四、RNA 的空間結構與功能
DNA 是遺傳信息的載體,而遺傳作用是由蛋白質功能來體現的,在兩者之間 RNA 起著中介作用。其種類繁多,分子較小,一般以單鏈存在,可有局部二級結構,各類 RNA 在遺傳信息表達為氨基酸序列過程中發揮不同作用。如:
 
名    稱    功    能
 
核蛋白體 RNA    (rRNA)    核蛋白體組成成分信使 RNA    (mRNA)    蛋白質合成模板
轉運 RNA    (tRNA)    轉運氨基酸
不均一核 RNA    (HnRNA)    成熟 mRNA 的前體
小核 RNA    (SnRNA)    參與 HnRNA 的剪接、轉運小核仁 RNA        (SnoRNA)    rRNA 的加工和修飾
 


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